Open Tree of Life
| Open Tree of Life | ||
|---|---|---|
| Información general | ||
| Dominio | opentreeoflife.org | |
| En español | No | |
| Licencia | BSD 2-clause (FreeBSD)[1] | |
| Estado actual | Activo | |
| Gestión | ||
| Lanzamiento | 2015 | |
| Estadísticas | ||
El Open Tree of Life es un árbol filogenético de la vida en línea, un esfuerzo colaborativo, financiado por la National Science Foundation.[2][3] El primer borrador, que incluye 2,3 millones de especies, se publicó en septiembre de 2015.[4] El gráfico interactivo permite al usuario acercarse a clasificaciones taxonómicas, árboles filogenéticos e información sobre un nodo. Al hacer clic en una especie, se devolverá su taxonomía de origen y referencia.
Acercamiento
[editar | editar código]El proyecto utiliza un enfoque de superárbol para generar un único árbol filogenético[5] a partir de una taxonomía completa y un conjunto curado de estimaciones filogenéticas publicadas.
La taxonomía es una combinación de varias clasificaciones grandes producidas por otros proyectos; se crea usando una herramienta de software llamada "smasher"[6] La taxonomía resultante se llama una taxonomía de árbol abierto (Open Tree Taxonomy, OTT) y se puede navegar en línea.[7]
Historia
[editar | editar código]El proyecto se inició en junio de 2012 con un premio NSF de tres años a investigadores de diez universidades. En 2015, se otorgó un premio complementario de dos años a los investigadores de tres instituciones.
Véase también
[editar | editar código]Referencias
[editar | editar código]- ↑ «OpenTreeOfLife License».
- ↑ Hinchliff, Cody E.; Smith, Stephen A.; Allman, James F.; Burleigh, J. Gordon; Chaudhary, Ruchi; Coghill, Lyndon M.; Crandall, Keith A.; Deng, Jiabin et al. (13 de octubre de 2015). «Synthesis of phylogeny and taxonomy into a comprehensive tree of life». Proceedings of the National Academy of Sciences (en inglés) 112 (41): 12764-12769. ISSN 0027-8424. doi:10.1073/pnas.1423041112.
- ↑ «Assembling, Visualizing, and Analyzing the Tree of Life». National Science Foundation (NSF). Consultado el 11 de febrero de 2016.
- ↑ Pennisi, Elizabeth (21 de septiembre de 2015). «First comprehensive tree of life shows how related you are to millions of species». Science Magazine.
- ↑ <mtholder@gmail.com>, Open Tree of Life developers. «opentree».
- ↑ «Automated assembly of a reference taxonomy for phylogenetic data synthesis». Biodiversity Data Journal 5 (5): e12581. 2017. PMC 5515096. PMID 28765728. doi:10.3897/BDJ.5.e12581.
- ↑ «tree.opentreeoflife.org».