Siphoviridae
| Siphoviridae | ||
|---|---|---|
|
Archivo:Gamma phage.png Fago gamma de Enterobacteria, un virus tipo λ | ||
| Taxonomía | ||
| Dominio: | Duplodnaviria | |
| Orden: | Caudovirales | |
| Familia: | Siphoviridae* | |
| Clasificación de Baltimore | ||
| Grupo: | I (Virus ADN bicatenario) | |
Siphoviridae fue una antigua familia de virus infectivos para procariotas (bacterias y arqueas) que contienía 22 subfamilias, 366 géneros y 1166 especies agrupados basado en la morfología del virion. En 2023 la familia fue abolida junto con las de otros caudovirus Myoviridae y Podoviridae tras demostrarse que son un conjunto polifilético, por lo que actualmente el término "sifovirus" se usa para referirse al morfotipo del virion de estos caudovirus.[1]
Los rasgos estructurales característicos de esta familia eran una cabeza no envuelta y una cola no contráctil.
Descripción
[editar | editar código]Los viriones tienen cápsides con geometrías icosaédricas y cabeza-cola (morfotipo B1) o una cápside alargada (morfotipo B2), y simetría T = 7. No poseen envoltura vírica. El diámetro es de unos 60 nm. Los virus de esta familia también se caracterizan por sus colas filamentosas, con bandas cruzadas y no contráctiles, generalmente con fibras terminales y subterminales cortas. Los genomas lineales y de ADN bicatenario con alrededor de 50 kb de longitud y contienen alrededor de 70 genes. El contenido de guanina/citosina suele rondar el 52%.
La replicación viral se produce en el citoplasma. La entrada en la célula huésped se logra mediante adsorción en la célula huésped. La replicación sigue el modelo de transposición replicativa. La transcripción con plantilla de ADN es el método de transcripción. La traducción se realiza mediante un desplazamiento del marco ribosómico -1 y un desplazamiento del marco ribosómico +1. El virus sale de la célula huésped por lisis y proteínas holina/endolisina/spanina. Las bacterias y las arqueas sirven como hospedadores naturales. Las rutas de transmisión son por difusión pasiva.
Taxonomía
[editar | editar código]Se habían descrito las siguientes subfamilias y géneros:
- Arquatrovirinae
- Azeredovirinae
- Bclasvirinae
- Bronfenbrennervirinae
- Chebruvirinae
- Dclasvirinae
- Deejayvirinae
- Dolichocephalovirinae
- Gochnauervirinae
- Guernseyvirinae
- Gutmannvirinae
- Hendrixvirinae
- Langleyhallvirinae
- Mccleskeyvirinae
- Mclasvirinae
- Nclasvirinae
- Nymbaxtervirinae
- Pclasvirinae
- Queuovirinae
- Skryabinvirinae
- Trabyvirinae
- Tybeckvirinae
Los siguientes géneros no fueron asignados a una subfamilia:
- Abbeymikolonvirus
- Abidjanvirus
- Agmunavirus
- Aguilavirus
- Ahduovirus
- Alachuavirus
- Alegriavirus
- Amigovirus
- Anatolevirus
- Andrewvirus
- Andromedavirus
- Annadreamyvirus
- Appavirus
- Apricotvirus
- Arawnvirus
- Armstrongvirus
- Ashduovirus
- Attisvirus
- Attoomivirus
- Audreyjarvisvirus
- Austintatiousvirus
- Avanivirus
- Bantamvirus
- Barnyardvirus
- Beceayunavirus
- Beetrevirus
- Behunavirus
- Bernalvirus
- Betterkatzvirus
- Bievrevirus
- Bingvirus
- Bowservirus
- Bridgettevirus
- Britbratvirus
- Bronvirus
- Brussowvirus
- Camtrevirus
- Casadabanvirus
- Cbastvirus
- Cecivirus
- Ceduovirus
- Ceetrepovirus
- Cequinquevirus
- Chenonavirus
- Cheoctovirus
- Chertseyvirus
- Chivirus
- Chunghsingvirus
- Cimpunavirus
- Cinunavirus
- Coetzeevirus
- Colunavirus
- Coralvirus
- Corndogvirus
- Cornievirus
- Coventryvirus
- Cronusvirus
- Cukevirus
- Daredevilvirus
- Decurrovirus
- Delepquintavirus
- Demosthenesvirus
- Detrevirus
- Deurplevirus
- Dhillonvirus
- Dinavirus
- Dismasvirus
- Doucettevirus
- Edenvirus
- Efquatrovirus
- Eiauvirus
- Eisenstarkvirus
- Elerivirus
- Emalynvirus
- Eyrevirus
- Fairfaxidumvirus
- Farahnazvirus
- Fattrevirus
- Feofaniavirus
- Fernvirus
- Fibralongavirus
- Fowlmouthvirus
- Franklinbayvirus
- Fremauxvirus
- Fromanvirus
- Gaiavirus
- Galaxyvirus
- Galunavirus
- Gamtrevirus
- Gesputvirus
- Getseptimavirus
- Ghobesvirus
- Gilesvirus
- Gillianvirus
- Gilsonvirus
- Glaedevirus
- Godonkavirus
- Goodmanvirus
- Gordonvirus
- Gordtnkvirus
- Gorganvirus
- Gorjumvirus
- Gustavvirus
- Halcyonevirus
- Hattifnattvirus
- Hedwigvirus
- Helsingorvirus
- Hiyaavirus
- Hnatkovirus
- Holosalinivirus
- Homburgvirus
- Hubeivirus
- Iaduovirus
- Ikedavirus
- Ilzatvirus
- Incheonvrus
- Indlulamithivirus
- Inhavirus
- Jacevirus
- Jarrellvirus
- Jenstvirus
- Jouyvirus
- Juiceboxvirus
- Junavirus
- Kairosalinivirus
- Kamchatkavirus
- Karimacvirus
- Kelleziovirus
- Kilunavirus
- Klementvirus
- Knuthellervirus
- Kojivirus
- Konstantinevirus
- Korravirus
- Kostyavirus
- Krampusvirus
- Kryptosalinivirus
- Kuleanavirus
- Labanvirus
- Lacnuvirus
- Lacusarxvirus
- Lafunavirus
- Lambdavirus
- Lambovirus
- Lanavirus
- Larmunavirus
- Laroyevirus
- Latrobevirus
- Leicestervirus
- Lentavirus
- Liebevirus
- Liefievirus
- Lillamyvirus
- Lokivirus
- Lomovskayavirus
- Luckybarnesvirus
- Luckytenvirus
- Lughvirus
- Lwoffvirus
- Magadivirus
- Majavirus
- Manhattanvirus
- Mapvirus
- Mardecavirus
- Marienburgvirus
- Marvinvirus
- Maxrubnervirus
- Mementomorivirus
- Metamorphoovirus
- Minunavirus
- Moineauvirus
- Montyvirus
- Mudcatvirus
- Mufasoctovirus
- Muminvirus
- Murrayvirus
- Nanhaivirus
- Nazgulvirus
- Neferthenavirus
- Nesevirus
- Nevevirus
- Nickievirus
- Nonanavirus
- Nyceiraevirus
- Oengusvirus
- Omegavirus
- Oneupvirus
- Orchidvirus
- Oshimavirus
- Pahexavirus
- Pamexvirus
- Pankowvirus
- Papyrusvirus
- Patiencevirus
- Pepyhexavirus
- Phifelvirus
- Picardvirus
- Pikminvirus
- Pleeduovirus
- Pleetrevirus
- Poushouvirus
- Predatorvirus
- Priunavirus
- Psavirus
- Psimunavirus
- Pulverervirus
- Questintvirus
- Quhwahvirus
- Radostvirus
- Raleighvirus
- Ravarandavirus
- Ravinvirus
- Rerduovirus
- Rigallicvirus
- Rimavirus
- Rockefellervirus
- Rockvillevirus
- Rogerhendrixvirus
- Ronaldovirus
- Roufvirus
- Rowavirus
- Ruthyvirus
- Samistivirus
- Samunavirus
- Samwavirus
- Sandinevirus
- Sanovirus
- Sansavirus
- Saphexavirus
- Sashavirus
- Sasvirus
- Saundersvirus
- Sawaravirus
- Scapunavirus
- Schnabeltiervirus
- Schubertvirus
- Seongbukvirus
- Septimatrevirus
- Seussvirus
- Sextaecvirus
- Skunavirus
- Slashvirus
- Sleepyheadvirus
- Smoothievirus
- Sonalivirus
- Soupsvirus
- Sourvirus
- Sozzivirus
- Sparkyvirus
- Spbetavirus
- Spizizenvirus
- Squashvirus
- Squirtyvirus
- Stanholtvirus
- Steinhofvirus
- Sukhumvitvirus
- Tandoganvirus
- Tankvirus
- Tantvirus
- Terapinvirus
- Teubervirus
- Thetabobvirus
- Tigunavirus
- Timquatrovirus
- Tinduovirus
- Titanvirus
- Tortellinivirus
- Triavirus
- Trigintaduovirus
- Trinavirus
- Trinevirus
- Triplejayvirus
- Unahavirus
- Uwajimavirus
- Vashvirus
- Vedamuthuvirus
- Vendettavirus
- Vhulanivirus
- Vidquintavirus
- Vieuvirus
- Vividuovirus
- Vojvodinavirus
- Waukeshavirus
- Wbetavirus
- Weaselvirus
- Whackvirus
- Whiteheadvirus
- Wildcatvirus
- Wilnyevirus
- Wizardvirus
- Woesvirus
- Woodruffvirus
- Xiamenvirus
- Xipdecavirus
- Yangvirus
- Yonseivirus
- Yuavirus
- Yvonnevirus
- Zetavirus
Referencias
[editar | editar código]- Prescott, L.M. (1999). Microbiología. McGraw-Hill Interamericana de España, S.A.U. ISBN 84-486-0261-7.
- ↑ Turner D, Shkoporov AN, Lood C, Millard AD, Dutilh BE, Alfenas-Zerbini P, van Zyl LJ, Aziz RK, Oksanen HM, Poranen MM, Kropinski AM, Barylski J, Brister JR, Chanisvili N, Edwards RA, Enault F, Gillis A, Knezevic P, Krupovic M, Kurtböke I, Kushkina A, Lavigne R, Lehman S, Lobocka M, Moraru C, Moreno Switt A, Morozova V, Nakavuma J, Reyes Muñoz A, Rūmnieks J, Sarkar BL, Sullivan MB, Uchiyama J, Wittmann J, Yigang T, Adriaenssens EM (January 2023). «Abolishment of morphology-based taxa and change to binomial species names: 2022 taxonomy update of the ICTV bacterial viruses subcommittee». Archives of Virology 168 (2): 74. PMC 9868039. PMID 36683075. doi:10.1007/s00705-022-05694-2.
Enlaces externos
[editar | editar código]- Viralzone: Siphoviridae (en inglés)
- ICTV (en inglés)
- Complete Genomes of Siphoviridae (en inglés)