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Uroporfirinógeno descarboxilasa

De Mexpedia
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Uroporfirinógeno descarboxilasa
Archivo:Protein UROD PDB 1jph.png
Representación de la estructura de la uroporfirinógeno descarboxilasa humana, mutación Ile260Thr.
Estructuras disponibles
PDB
Estructuras enzimáticas
Identificadores
Nomenclatura
Otros nombres
Uroporfirinógeno III descarboxilasa, porfirinógeno carboxiliasa, porfirinógeno descarboxilasa, uroporfirinógeno III carboxiliasa
Símbolo UROD (HGNC: 12591)
Identificadores
externos
  • UniProt: UROD
  • Bases de datos de enzimas

    BRENDA: entrada en BRENDA

    ExPASy: NiceZime view
    KEGG: entrada en KEEG
    PRIAM: perfil PRIAM
    ExplorEnz: entrada en ExplorEnz
    MetaCyc: vía metabólica
    Número EC 4.1.1.37
    Locus Cr. 1 p34.1
    Estructura/Función proteica
    Tamaño 367[1] (aminoácidos)
    Funciones • Actividad uroporfirinógeno descarboxilasa
    Datos biotecnológicos/médicos
    Enfermedades Porfiria cutánea tarda, porfiria hepatoeritropoyética
    PubMed (Búsqueda)
    [1]


    PMC (Búsqueda)
    [2]
    Página no enlazada a Wikidata y añade el enlace en español: Uroporfirinógeno descarboxilasa.

    La uroporfirinógeno descarboxilasa (uroporfirinógeno III descarboxilasa o UROD) es una enzima perteneciente al grupo de las liasas codificada por el gen UROD.[2]

    La uroporfirinógeno descarboxilasa es una enzima homodimérica que cataliza el quinto paso de la síntesis del grupo hemo, que se corresponde con la eliminación de grupos carboxilo de las cuatro cadenas laterales de acetato del uroporfirinógeno III para obtener coproporfirinógeno III:

    uroporfirinógeno III ⇌ coproporfirinógeno III + 4 CO
    2

    Importancia clínica

    [editar | editar código]

    Las mutaciones de esta enzima causan porfiria cutánea tarda tipo II (familiar) y porfiria hepatoeritropoyética.[2]

    Mecanismo

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    A una concentración baja de sustrato, la reacción parece seguir un orden establecido en el que se eliminan los grupos carboxilos de los anillos D, A, B y C, mientras que a una concentración mayor de sustrato, el orden parece ser aleatorio. La enzima funciona como un dímero en disolución, y tanto las enzimas humanas como las del tabaco han sido cristalizadas y resueltas en alta resolución.

    Archivo:Uroporphyrinogen-decarboxylase.svg
    La reacción catalizada por UROD.

    UROD es una descarboxilasa especial, ya que cataliza la reacción sin la intervención de cofactores, necesarios en la mayoría de descarboxilasas. Se ha propuesto que su mecanismo se produzca mediante la protonación del sustrato con un residuo de arginina.[3] En 2008 se demostró que el ratio de la reacción de UROD sin catálisis es de 10−19 s−1, por lo que a un pH de 10 la aceleración relativa en presencia de la enzima, o eficiencia enzimática, es el mayor de todas las enzimas conocidas, 6 x 1024 M−1.[4]

    Archivo:UroD mechanism.svg
    Mecanismo propuesto para la reacción de la uroporfirinógeno descarboxilasa

    Referencias

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    1. ↑ «uroporphyrinogen decarboxylase [Homo sapiens]». NCBI (en inglés). Consultado el 17 de enero de 2020. 
    2. ↑ 2,0 2,1 «Entrez Gene: UROD uroporphyrinogen decarboxylase» (en inglés). Consultado el 17 de enero de 2020. 
    3. ↑ Silva, PJ; Ramos, MJ (2005). «Density-functional study of mechanisms for the cofactor-free decarboxylation performed by uroporphyrinogen III decarboxylase.». Journal of Physical Chemistry B (en inglés) 109: 18195-18200. doi:10.1021/jp051792s. 
    4. ↑ Lewis, CA; Wolfenden, R (noviembre de 2008). «Uroporphyrinogen decarboxylation as a benchmark for the catalytic proficiency of enzymes». Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (en inglés) 105 (45): 17328-17333. PMC 2582308. PMID 18988736. doi:10.1073/pnas.0809838105. 

    Enlaces externos

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