Grupo FCB

Grupo FCB
Taxonomía
Dominio:	Bacteria
Reino:	Pseudomonadati
Superfilo:	Grupo FCB, Gupta 2004, o; Sphingobacteria Cavalier-Sm. 1987
Filos
	Fibrobacterota; Bacteroidota; Gemmatimonadota; Cloacimonadota; Fidelibacterota; Latescibacteriota; Fermentibacterota; Zixiibacteriota; Calditrichota; Delphinibacteriota; Hydrogenedentota; Hydrothermota; Arandabacterota; Blakebacterota; Joyabacterota; Orphanbacterota; Delongibacteriota; Raymondikbacteriota; Eisenibacteriota; Edwardsiibacteriota; Krumholzibacteriota;
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El grupo FCB o el Sphingobacteria es un clado o grupo filogenético de bacterias gramnegativas que en su mayoría son anaerobias, al que se le asigna usualmente rango de superfilo. Incluye a Bacteroidota, Fibrobacterota, Gemmatimonadota y varios filos candidatos. FCB pertenece a su vez a un reino mayor: Pseudomonadati. Evolutivamente se caracterizan por ser bacterias Gram negativas que desarrollaron esfingolípidos o sulfonolípidos, con amplia pérdida de flagelos, alta movilidad por deslizamiento.^[1]^[2]

Cavalier-Smith denomina a este clado Sphingobacteria.^[1] El valor filogenético de este grupo está respaldado por análisis genómico-proteicos, así como por el ARNr 16S.^[3]

Filogenia

Una filogenia algo consensuada en el GTDB database y el Annotree es la siguiente:^[4]^[5]

FCB

Hydrogenedentota

Blakebacterota

Joyabacterota

	Latescibacteriota

	Delphinibacteriota

	Edwardsiibacteriota

	Zixiibacteriota

Krumholzibacteriota

Eiseniibacteriota

	Arandabacterota

	Orphanbacterota

	Fermentibacterota

	Gemmatimonadota

Hydrothermota

Cloacimonadota

	Raymondikbacteriota

	Fibrobacterota

	Kryptonia

	Ignavibacteria

Chlorobia

	Rhodothermia

	Bacteroidia

Otros autores consideran que Fibrobacterota forma un clado con Gemmatimonadota.^[6] El filo candidato Hydrogenedentota fue incluido por estudios recientes^[7] y por el NCBI,^[8] aunque estudios anteriores los exluían.

Véase también

Grupo PVC

Referencias

↑ ^1,0 ^1,1 Cavalier-Smith T (2006). "Rooting the tree of life by transition analyses". Biol. Direct 1: 19. doi:10.1186/1745-6150-1-19
↑ Hamilton, T. L., Bovee, R. J., Sattin, S. R., Mohr, W., Gilhooly III, W. P., Lyons, T. W., ... & Macalady, J. L. (2016). Carbon and sulfur cycling below the chemocline in a meromictic lake and the identification of a novel taxonomic lineage in the FCB superphylum, Candidatus Aegiribacteria. Frontiers in microbiology, 7.
↑ Gupta, R. S. (2004). "The Phylogeny and Signature Sequences Characteristics of Fibrobacteres,Chlorobi, and Bacteroidetes". Critical Reviews in Microbiology 30 (2): 123–143.
↑ Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). «AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life». Nucleic Acids Research 47 (9): 4442-4448. PMC 6511854. PMID 31081040. doi:10.1093/nar/gkz246. Archivado desde el original el 23 de abril de 2021. Consultado el 21 de julio de 2021.
↑ «GTDB release 05-RS95». Genome Taxonomy Database.
↑ Christian Rinke et al 2013. Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter. Nature Volume: 499, Pages: 431–437 doi:10.1038/nature12352
↑ Emiley A Eloe-Fadrosh et al. 2017, Global metagenomic survey reveals a new bacterial candidate phylum in geothermal springs. Nature Communications 7 · January 2016 DOI: 10.1038/ncomms1047
↑ NCBI Taxonomy Browser: FCB group (clade).

[Cavalier-S-1] 1,0 ^1,1 Cavalier-Smith T (2006). "Rooting the tree of life by transition analyses". Biol. Direct 1: 19. doi:10.1186/1745-6150-1-19

[hamilton2016-2] Hamilton, T. L., Bovee, R. J., Sattin, S. R., Mohr, W., Gilhooly III, W. P., Lyons, T. W., ... & Macalady, J. L. (2016). Carbon and sulfur cycling below the chemocline in a meromictic lake and the identification of a novel taxonomic lineage in the FCB superphylum, Candidatus Aegiribacteria. Frontiers in microbiology, 7.

[3] Gupta, R. S. (2004). "The Phylogeny and Signature Sequences Characteristics of Fibrobacteres,Chlorobi, and Bacteroidetes". Critical Reviews in Microbiology 30 (2): 123–143.

[4] Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). «AnnoTree: visualization and exploration of a functionally annotated microbial tree of life». Nucleic Acids Research 47 (9): 4442-4448. PMC 6511854. PMID 31081040. doi:10.1093/nar/gkz246. Archivado desde el original el 23 de abril de 2021. Consultado el 21 de julio de 2021.

[5] «GTDB release 05-RS95». Genome Taxonomy Database.

[6] Christian Rinke et al 2013. Insights into the phylogeny and coding potential of microbial dark matter. Nature Volume: 499, Pages: 431–437 doi:10.1038/nature12352

[fadrosh-7] Emiley A Eloe-Fadrosh et al. 2017, Global metagenomic survey reveals a new bacterial candidate phylum in geothermal springs. Nature Communications 7 · January 2016 DOI: 10.1038/ncomms1047

[ncbi-8] NCBI Taxonomy Browser: FCB group (clade).

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