Editando Transcriptoma (sección)

=== Secuenciación de ARN ===
La técnica más empleada en la actualidad es la '''secuenciación de ARN''' ('''RNA-seq'''),<ref name=":1">{{Cita publicación|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18516045|título=Mapping and quantifying mammalian transcriptomes by RNA-Seq|apellidos=Mortazavi|nombre=Ali|apellidos2=Williams|nombre2=Brian A.|fecha=2008-7|publicación=Nature Methods|volumen=5|número=7|páginas=621–628|fechaacceso=24 de febrero de 2019|issn=1548-7105|doi=10.1038/nmeth.1226|pmid=18516045|apellidos3=McCue|nombre3=Kenneth|apellidos4=Schaeffer|nombre4=Lorian|apellidos5=Wold|nombre5=Barbara}}</ref><ref>{{Cita publicación|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18451266|título=The transcriptional landscape of the yeast genome defined by RNA sequencing|apellidos=Nagalakshmi|nombre=Ugrappa|apellidos2=Wang|nombre2=Zhong|fecha=6 de junio de 2008|publicación=Science (New York, N.Y.)|volumen=320|número=5881|páginas=1344–1349|fechaacceso=24 de febrero de 2019|issn=1095-9203|doi=10.1126/science.1158441|pmc=2951732|pmid=18451266|apellidos3=Waern|nombre3=Karl|apellidos4=Shou|nombre4=Chong|apellidos5=Raha|nombre5=Debasish|apellidos6=Gerstein|nombre6=Mark|apellidos7=Snyder|nombre7=Michael}}</ref> la cual puede detectar tanto genes conocidos como desconocidos, además de cuantificar su expresión directa y no indirectamente.<ref name=":0" /> La secuenciación de ARN comienza con la conversión de las moléculas de ARN a [[ADN complementario]] (cDNA) mediante [[RT-PCR|PCR reversa]] (RT-PCR). El ADN complementario es entonces amplificado para formar una [[Genoteca|biblioteca de ADN]], la cual puede ser secuenciada.<ref name=":1" /> El resultado final es una serie de secuencias que pueden ser [[Alineamiento de secuencias|alineadas]] al genoma o transcriptoma y después cuantificadas mediante métodos computacionales.<ref>{{Cita publicación|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26813401|título=A survey of best practices for RNA-seq data analysis|apellidos=Conesa|nombre=Ana|apellidos2=Madrigal|nombre2=Pedro|fecha=26 de enero de 2016|publicación=Genome Biology|volumen=17|páginas=13|fechaacceso=24 de febrero de 2019|issn=1474-760X |doi=10.1186/s13059-016-0881-8 |pmc=4728800|pmid=26813401 |apellidos3=Tarazona|nombre3=Sonia |apellidos4=Gomez-Cabrero|nombre4=David |apellidos5=Cervera|nombre5=Alejandría |apellidos6=McPherson|nombre6=Andrew |apellidos7=Szcześniak|nombre7=Michał Wojciech |apellidos8=Gaffney|nombre8=Daniel J. |apellidos9=Elo|nombre9=Laura L.}}</ref> Esto permite saber de qué gen proviene cada secuencia y cuántas secuencias le corresponden a cada gen. El número de secuencias alineadas a un gen determinado es proporcional al número de moléculas de ARN provenientes del mismo.<ref name="Hurst,2026"/>