Editando Neotrygon annotata (sección)

== Taxonomía y filogenia ==
La primera descripción científica de la raya común fue obra del investigador Peter Last, de la [[Organización de Investigación Científica e Industrial del Commonwealth|Organización de Investigación Científica e Industrial de la Commonwealth]] (CSIRO), en un número de 1987 de ''Memoirs of the National Museum of Victoria''. El [[nombre específico]] ''annotatus'' procede del latín ''an'' («no») y ''notatus'' («marcado»), y hace referencia a la coloración de la raya. El [[holotipo]] es un macho de 21,2 cm (8,3 pulgadas) de diámetro, capturado frente a [[Australia Occidental]];<ref name=":1">{{Cita publicación|título=Sharks and Rays of Australia (second ed.)|apellidos=Last, PR; Stevens, JD|fecha=2009|publicación=Harvard University Press|isbn=978-0-674-03411-2}}</ref> también se designaron varios [[paratipos]]. Last colocó provisionalmente la especie en el género ''[[Dasyatis]]'', señalando que pertenecía al grupo de especies de «rayas máscara» que también incluía a la raya de manchas azules (entonces ''[[Dasyatis kuhlii]]'').<ref name=":2">{{Cita publicación|url=https://museumsvictoria.com.au/collections-research/journals/memoirs-of-museum-victoria/volume-48-issue-1-1987/57-61/|título=New Australian fishes. Part 14. Two new species of Dasyatis (Dasyatididae)|apellidos=Last|nombre=P. R.|fecha=1987-10-31|publicación=Memoirs of Museum Victoria|volumen=48|número=1|páginas=57–61|fechaacceso=2024-11-05|idioma=inglés|doi=10.24199/j.mmv.1987.48.14}}</ref> En 2008, Last y William White elevaron el grupo ''kuhlii'' al rango de género completo como ''Neotrygon'', sobre la base de pruebas morfológicas y [[Filogenética molecular|filogenéticas]] moleculares.<ref>{{Cita publicación|título="Resurrection of the genus Neotrygon Castelnau (Myliobatoidei: Dasyatidae) with the description of Neotrygon picta sp. nov., a new species from northern Australia"|apellidos=Last, PR; White, WT|fecha=2008|publicación=Descriptions of New Australian Chondrichthyans. CSIRO Marine and Atmospheric Research|issn=1835-1476}}</ref>

En un análisis filogenético de 2012 basado en el [[ADN mitocondrial nuclear|ADN mitocondrial y nuclear]] , se descubrió que la raya de llanura y la raya de Ningaloo (''N. ningalooensis'') eran los miembros más [[Basal|basales]] de ''Neotrygon''. La divergencia del linaje ''de N. annotata'' se estimó en ~54 Ma. Además, los individuos secuenciados en el estudio se clasificaron en dos [[Clado|clados]] genéticamente distintos, lo que sugiere que ''N. annotata'' es un complejo de [[especies crípticas]]. Se estima que las dos especies putativas divergieron hace ~4,9 Ma; el acontecimiento precipitante fue probablemente la división de la población ancestral por cambios en la línea de costa.<ref>{{Cita publicación|url=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3586632|título="Phylogeography of the Indo-West Pacific maskrays (Dasyatidae, Neotrygon): a complex example of chondrichthyan radiation in the Cenozoic"|apellidos=Puckridge, M; Last, PR; White, WT; Andreakis, N|fecha=2012|publicación=Ecology and Evolution|doi=10.1002/ece3.448|pmid=23467194}}</ref>